FAS samarbetar kring direkta forskningssatsningar med andra forskningsfinansiärer i avgränsade forskningsprogram, t.ex. handikappforskning och forskning om barns hälsa.
Inom arbetslivsforskningen samverkar FAS med Vinnova, särskilt i analysarbetet kring arbetslivsforskningens omfattning och inriktning.
Samarbetet med andra ligger också i det samordningsansvar FAS har beträffande forskning om alkohol, äldre, barn och ungdom, migration och etniska relationer samt handikapp. Här görs bl.a. regelbundna inventeringar av olika forskningsfinansiärers satsningar inom dessa områden.
Samverkan med andra forskningsfinansiärer sker även kring internationella och forskningspolitiska frågor liksom informationsfrågor.
