FAS ska enligt sin instruktion fördela medel till den forskning som har högst vetenskaplig kvalitet inom sitt ansvarsområde. Därför fördelas inga forskningsmedel utan att alla forskare har beretts möjlighet att söka.
Inkomna ansökningar granskas i FAS prioriteringskommittéer, som består av ledande forskare och allmänföreträdare inom FAS olika ansvarsområden, och bedöms av utomstående expertis, inte sällan internationell sådan.
Återrapportering krävs, och information om projekten redovisas i FAS forskningsdatabas. Därutöver görs fördjupade utvärderingar av forskningen inom avgränsade forskningsområden.
Det är av största vikt att undvika jäv i handläggningen. FAS tillämpar därför särskilda jävsregler.
